Protein–RNA interactions for Protein: O15194

CTDSPL, CTD small phosphatase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPLO15194 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CTDSPLO15194 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms