Protein–RNA interactions for Protein: O14817

TSPAN4, Tetraspanin-4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4O14817 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TSPAN4O14817 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms