Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PDCD5O14737 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PDCD5O14737 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms