Protein–RNA interactions for Protein: O00213

APBB1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB1O00213 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APBB1O00213 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APBB1O00213 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
APBB1O00213 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APBB1O00213 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APBB1O00213 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APBB1O00213 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms