Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SNAP23O00161 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms