Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
USP17L12C9JPN9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP17L12C9JPN9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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