Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMTA1Q9Y6Y1 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms