Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CHTOPQ9Y3Y2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms