Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHBDD3Q9Y3P4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHBDD3Q9Y3P4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms