Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 AP002336.2-201ENST00000528607 539 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATF5Q9Y2D1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms