Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SHOC2Q9UQ13 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SHOC2Q9UQ13 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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