Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HPS5Q9UPZ3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HPS5Q9UPZ3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms