Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCML1Q9UN30 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms