Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
INO80Q9ULG1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
INO80Q9ULG1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms