Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAPPC2LQ9UL33 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRAPPC2LQ9UL33 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms