Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AMFRQ9UKV5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms