Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GGA2Q9UJY4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms