Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1Q9UJ41 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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RABGEF1Q9UJ41 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RABGEF1Q9UJ41 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
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