Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IFT172Q9UG01 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IFT172Q9UG01 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms