Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CGGBP1Q9UFW8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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