Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CTNNAL1Q9UBT7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CTNNAL1Q9UBT7 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms