Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SPASTQ9UBP0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms