Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MGAT4CQ9UBM8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MGAT4CQ9UBM8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms