Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD4AQ9P2Q2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD4AQ9P2Q2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms