Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C9orf78Q9NZ63 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms