Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
HOXC10Q9NYD6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms