Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MS4A12Q9NXJ0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms