Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHBDL2Q9NX52 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms