Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IFT57Q9NWB7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IFT57Q9NWB7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms