Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SPTLC3Q9NUV7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SPTLC3Q9NUV7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms