Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG3Q9NT62 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG3Q9NT62 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms