Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
EMILIN3Q9NT22 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EMILIN3Q9NT22 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms