Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC6A13Q9NSD5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SLC6A13Q9NSD5 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms