Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RASSF1Q9NS23 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RASSF1Q9NS23 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms