Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ASCL3Q9NQ33 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms