Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNRC6CQ9HCJ0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNRC6CQ9HCJ0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms