Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RSPH6AQ9H0K4 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RSPH6AQ9H0K4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms