Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ASXL3Q9C0F0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms