Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HDAC8Q9BY41 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms