Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CARD11Q9BXL7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CARD11Q9BXL7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms