Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
SYCP2Q9BX26 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYCP2Q9BX26 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms