Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW11

MXD3, Max dimerization protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXD3Q9BW11 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MXD3Q9BW11 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MXD3Q9BW11 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms