Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RTKNQ9BST9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms