Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
EBF4Q9BQW3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EBF4Q9BQW3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms