Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SLF1Q9BQI6 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SLF1Q9BQI6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms