Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NIPSNAP1Q9BPW8 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms