Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RBBP8Q99708 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms