Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHOX2BQ99453 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHOX2BQ99453 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms