Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CICQ96RK0 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CICQ96RK0 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms