Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ARXQ96QS3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ARXQ96QS3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms